Във връзка с изпълнение на функциите и задачите, отделите в Регионална инспекция по околната среда и водите – Русе са организирани в обща и специализирана администрация.
Те са определени в Длъжностно разписание, утвърдено от Министъра на околната среда и водите, в сила от 1 юни 2015 година.
Обща администрация
Дирекция: "Административни, финансови и правни дейности"
Специализирана администрация
Дирекция: "Контрол на околната среда"
Отдел: "Управление на отпадъците и опазване на почвите"
Отдел: "Въздух и вредни физични фактори, води, КПКЗ и ОХВ"
-Направление "Опазване чистотата на атмосферния въздух и вредни физични фактори"
-Направление "Опазване на водите"
-Направление "Комплексно предотвратяване и контрол на замърсяването (КПКЗ), екологична отговорност и доброволни ангажименти"
-Направление "Опасни химични вещества и контрол на риска от големи аварии с опасни химични вещества"
Дирекция: "Превантивна дейност"
Направление "ЕО, ОВОС и ОС"
Направление "Специализирани регистри"
Направление "Биологично разнообразие, защитени територии и зони"